раньше заводил на каждого клиента/сотрудника счет но оказалось муторно слишком и сейчас просто работаю с ними через классификаторы "предмет оплаты" "плательщик" "физ.лицо"
физ лицо заполняю только когда оное присутствует.
Например для зарплаты: "предмет оплаты" - зарплата/премия а "физ.лицо" Иванов И.И.
  Когда покупаю чтонить для клиента, например материалы, то в поле "Плательщик" ставлю того клиента, которому покупка. Таким образом в отчете видна маржа по клиенту, т.е. с учетом затрат на него.
  Чтобы отслеживать долги - делаю операцию в состоянии "не выполнена"
 
В чем проблема с зарплатой? как цифру посчитать или как ее учесть?