К сожалению, подгружаемая база не изменяется никак (Проверено %-) )
Уже столкнулся с рядом проблем, когда в базе-IMPORT были сделаны какие-то изменения: операции, классификаторы особенно изменения в них, порядок счетов.
Поэтому после импорта и возникают проблемы, когда в исходной базе уже всё, вроде бы подправил, а в результирующей все старые косяки остались да ещё и новоимзменонное появилось - запутывает в момент!