Да...
 
А статью, по которой будете проводить операцию "остаток" можете выбрать любую. Так же, как и при операциях "приход" и "расход".
 
А можете и не выбирать. Тогда это пойдет в неучтенный расход.
Все просто. (Хотя бы в плане логики работы данной команды).
 
Ну а в плане реализации - насколько будет сложно - лучше и точнее Dervish сможет ответить.