BDE юзают, если исходно всё написано на дельфях.
А так вариантов много, смотря на чём пишем.
Тот же MSDE, на крайняк. Места, правда, занимает как слон, зато бесплатно и поддерживается.
Главное в этом деле не закладываться на хранимые процедуры, что привяже софтину к одной базе.