Эта ошибка как раз и приводит к тому, что операции не импортируются. Вроде остальных данных это не касается. Ошибка уже исправлена, 194-й билд должен работать правильно.
 
Можно поступить вот как:
 
1. Экспортируете в Excel только классификаторы.
2. Подправляете файл Excel-я так, проставляя + в SingleTree.
3. Открываете страницу Классификаторов (по умолчанию спрятана, чтобы показать нужно из меню "Просмотр" выбрать пункт "Страницы" и в диалоге отметить страничку "Классификаторы").
4. Изменяете названия классификаторов, которые вам нужно переделать. Новые названия не должны совпадать с названиями, которые есть в Excel-евском файле.
5. Вызываете импорт подготовленного ранее файла Excel-я. После импорта вы получите в одной базе оба дерева классификаторов.
6. Открываете страницу операций и вручную проставляете новые значения классификаторов. Это можно сделать довольно быстро (есть навык, я это уже делал), если одновременно редактировать несколько операций.
7. Удаляете старые классификаторы, они более вам не нужны.