Начисляешь сумму по итогам периода: перевод на счет "мои долги" со счетов "налог1", "налог2", потом переводишь с денежного счета суммы на "налогN", ждешь сверки, переводишь с "мои долги" на "налоги" переплату, всегда потом видишь суммы переплат, а когда они приходят - отражаешь переводом с "налогов" на денежный.
"Пришлось создать статью «Возврат налогов», но это неудобно, " - IMHO, либо так, либо двойная запись с переводами, как я предлагаю. Кстати говоря,готовая "опция создания пользовательских категорий без жесткой привязки к виду операции" - это "Счет".
Остатки на нем бывают и отрицательными.
Только   сейчас обнаружил, что "Статей" в том смысле, которые у меня были, например, при работе с CashFly, теперь у меня вообще нет. Только работа со счетами,валютами (в т.ч.товарными), товарами, контрагентами. То есть, у меня  концепция учета, похоже, слишком отличается от принятой при использовании "Домашних" систем. Тогда - извини! Честь и хвала Дервишу за его универсальный продукт!