по первому абзацу даже и не знаю, что сказать... сомневаюсь, что операции дублировались, второй пользователь не слишком опытен и не занимался дублированием операций, если я правильно понял смысл фразы "...если есть дублирующиеся записи он будет считать, что записи эквивалентны и не будет делать дубликат...".
А вот "пропадание записей" при открытии файла на чтение - а я тоже предполагал, что источник должен открываться на чтение - для меня тоже осталось загадкой, но вот эфект-то я наблюдал своими глазами!!! Мистика да и только! Попробую ситуацию повторить, а пока будем считать, что произошло недоразумение.
 
Dervish: Нет, имелось в виду не дублирование операций пользователем, а то, что операции совершенно эквивалентны, все поля в них равны.
 
Если будет дополнительная информация, буду очень за неё благодарен.