Заведите группы счетов "Кредит" и "Депозит".
Например вы получили кредит 50000 руб. от Х-Банка.
Заведите счет "Х-Банк" в группе счетов "Кредит" и сделайте перевод со счета "Х-Банк" на счет, допустим, "Наличные".
Вот и всё :-).
 
Dervish: Это может работать только во второй версии. В первой версии нет групп счетов.