Для этого понадобится редактор DB Browser for SQLite. Он сможет открыть только файл, с которого снят пароль. Открываете файл, в нем есть две таблички: CurrencyRates, это, собственно, курсы валют. И вторая таблица, это Currencies, это сами валюты.
 
Из таблицы CurrencyRates удаляете ненужное (в столбцах Currency1 и Currency2 идентификаторы валют, к которым относится курс) и сохраняете изменения. Либо, можно проставить значение Deleted в 1-ку, это будет тот же эффект.
 
Не забудьте перед началом редактирования файла с данными сделать его резервную копию.