Если выгружали со страницы операций (там есть в меню "Действия" пункт "Выгрузить операции в Excel", то ответ на Ваш вопрос - нет.
 
Если же выгрузка была через мастер экспорта (меню "Файл", пункт "Экспорт данных"), то этот файл Excel должен быть пригоден для импорта. Единственное, при таком переносе потеряются данные о бюджете и серии данных.
 
Посмотрите, если в книге Excel есть лист "Transactions", то данные могут быть импортированы. Если такого листа нет, значит, Вы выгружали только операции, а этой информации недостаточно для импорта.