Я видел на форме флажок "Расчитать кросс-курсы". Если меня не подводит моя интуиция, там вполне может быть конструкция вроде
 
Если РассчитатьКроссКурсы == 1 Тогда
    РасчитатьКроссКурсы(Форма.ОсновнаяВалюта, ДатаЗагрузки)
КонецЕсли;
 
Вот и подумалось мне, что дать пользователю форму с похожими возможностями, было бы достаточно просто, и пользователи (ну, или пользователь) были бы рады. Ведь ничего нет сложного в добавление формочки с функцией по кнопке:
 
Для (ДатаИтер = НачДата; ДатаИтер <= КонДата; ДатаИтер ++) Цикл
РасчитатьКроссКурсы(ВыбраннаяВалюта, ДатаИтер)
КонецЦикла;
 
Правда, я не знаю, как выглядит Ваше приложение изнутри, но, полагаю, что оно достаточно хорошо разбито на модули и подпрограммы