1. Выбрать в поле "По счету" папку счетов, тогда будут показываться операции по всем счетам, входящим в эту папку.
 
2. Из меню "Сервис" выбираем "Настройки программы", в появившемся диалоге открываем 4-ю вкладку "Операции" и ставим галочку в поле "Развернутый список счетов". Нажимаем ОК. После этого все закладки "Операции" в программе изменяется и можно будет галочками выбирать нужные счета.