рассмотрите в качестве центральной базы обычные почтовые сервера с доступом по протоколу IMAP. Протокол простой, с лёгкостью организуется многоуровневый формат хранения записей в виде дерева, т.к. IMAP поддерживает обычную древовидную структуру а-ля файловое хранилище. А записи в виде обычных текстовых писем в удобном формате: хоть читаемом хоть xml.
Удобство в том, что легко найти сервер и несложно написать протокол, уж отдельную папку для содержимого нужной программы любой пользователь легко вытерпит, особенно если для чтения и понимания содержимого ему не потребуется программа, т.е. он при желании сможет посмотреть что его интересует с мобилы даже без наличия клиента под данную платформу