В настройках базы (см. меню Файл) можно выключить "Одноуровневый список счетов". Тогда у счетов появится "родитель" - Все счета.
Достаточно будет кликнуть галочку напротив него, чтобы отметить все счета сразу.
 
А ещё отмеченные в отчётах счета можно сохранить.
Alt+S или "Сохранить настройки страницы" в меню Действия.
Тогда не придётся каждый раз отмечать их заново.
 
Кроме того, страниц с отчётами можно создать несколько. И настроить их на разные виды отчётов, группы счетов, параметры.
См. "Страницы..." в меню Просмотр.