... включите в настройках базы (см. меню Файл) опцию "Представлять счета в виде дерева".
 
Тогда для любой созданной вами группы (а также для "корневой" группы "Все счета") можно будет одним кликом поставить/снять галочки на всех счетах, входящих в группу.