Т.е. действительно каждая выплата будет состоять из двух транзакций:
- перевод "Наличные => Кредит"
- расход по статье "Проценты по кредиту"
 
Другой вариант: создавать на кредитном счету каждый месяц расходную операцию для набежавших процентов.
Тогда остаток на нём будет показывать общую сумму долга с учётом процентов, а погашение будет осуществляться простым переводом.