дублирование классификаторов с номером происходит тогда, когда не совпадают параметры классификаторов! А я столько промучался, через XSLX колдовал...
 
Правда объединить часть баз мне удалось не сразу - постоянно выскакивала ошибка (даже не смотря на то, что я привел параметры классификаторов в порядок) и программа падала
 

 
Либо потом множество "Классификатор не используется в переводах" - опять же параметры классификаторов и имена совпадали в точности. Возникала при экспорте-импорте в XSLX, через XML все прошло корректно.
 
Но все же, через некоторое время удалось...