Если нет прав Администратора, то в Programm Files ничего и не установится (если не разрешено). Лучше ini файл, конечно, хранить в папке вместе с программой.
 
Dervish: Некоторые пользователи устанавливают программу под правами администратора (если она не устанавливается под обычными правами), а работают с ней с обычного логина, без прав администратора.