Прошу прощения но мне не совсем понятно как я потом буду делать исправления а основном файле.
может я неправильно написал, или я не совсем понимаю.
 
1. У меня есть база со всеми своими данными
2. В этой базе есть ошибки (см. сообщения выше)
3. Я отдаю в ремонт базу без определенного (критичного) набора данных, но с стабильными ошибками
 
Вопрос. после того как Вы определите причину ошибок в базе п.3 я смогу самостоятельно исправить эти же ошибки в базе п.1