2.2.1 Принадлежность денег определяется принадлежностью счетов, на кот. они находятся.
2.2.2 Из параметров и аналитики операции прихода
2.2.3 Из параметров и аналитики операции расхода
 
Все ваши вопросы в основном касаются остатков, находящихся в вашем управлении. Для учета остатков используются счета, управление устатками осуществляется через структуру счетов. В вашем случае, под каждый проект вам имеет смысл сделать свой счет.