После некоторых раздумий, "вычитание в бюджетах" (п.1) можно расширить: вместо галки "инвертировать" сделать поле, где указать процент от оборота по данной серии, который участвует в бюджете. Отрицательный процент будет вычитать результат из суммы бюджетных статей в папке.