Поэкспериментировал с копией базы на предмет различных вариантов удаления.  
Никакого криминала вроде не заметно (кроме собственно дублирования доп.примечаний).  
Т.е. после удаления таких операций вроде никаких проблем с базой не заметно.
Или эта проблема скрытая и может проявиться не сразу?