В такой ситуации я вижу два варианата.
1. Ручной вариант. Данная операция распадается на две: перевод суммы со счета в банке на "счет Наличные" и операция "Взятие комиссии" из группы операций расхода. Обе операции выполняются вручную.
2. Автоматический вариант. Если в программе будет предусмотрено автоматическое формирование порождаемых операций, то формируется только операция перевода, а операция "Взятие комиссии" будет выполнена автоматически.
САМОЕ ГЛАВНОЕ!!!
все вышерассмотренное не имеет никакого отношения к тому, что я предлагал. Операции перевода (прихода, расхода) таковыми и остаются. Просто их будет несколько - несколько операций расхода, несколько перевода и т.д. И все. Ничего кардинально не меняется. Просто учитывать проще. Каждый раз я вижу не только то, что произошла, например, операция перевода, но и то, что это перевод КОНКРЕТНО с банковского счета на счет Наличные.