...Loki, вам поможет сохранение настройки страницы. Выбираете нужный вам счёт (по умолчанию), далее из меню "Действия" пункт "Сохранить настройки страницы" и после этого сохранить базу даннных. После этого при последующем запуске программы на странице операций автоматом будет выбираться нужный вам счёт.
 
Кстати №1: угодить абсолютно всем невозможно. Или, как в народе говорят, всем нравится только червонец. С этим нужно просто смириться.
 
Кстати №2: переведите базу данных в режим иерархических счетов и будет вам счастье. Для этого: из меню "Файл" нужно выбрать пункт "Настройки базы" и в появившемся окне погасить самую верхнюю галочку.
 
Кстати №3: к сожалению в списках друг дружке мешают (а) выбор нескольких строк, так называемый мультиселект - то, о чём пишете вы и (б) перетаскивание самих строк. Это когда, например, нужно перетащить ветку в статьях расходов (или счетов) на другого родителя. Мешаются и путаются чисто интерфейсно. В общем, пока я сделал так как есть, а там дальше посмотрим.