Настройки программы НЕЛЬЗЯ сохранять в реестре. Это нужно делать или в самой базе данных или в INI-файле (с условием, что в качестве параметра командной строки можно будет указать путь к такому файлу, как в Windows Commander`е). Если сохранять настройки в реестре, то программа станет немобильной (вспомните, кстати, что форматы реестров Win95/98 и WinNT/2000/XP РАЗНЫЕ).