Статьи теперь стали "Классификаторами", включаются в меню "Просмотр-Страницы". Потом можно создать статьи прихода, расхода и все, что угодно (если я правильно понял идею).
 
Дерево счетов включается в "Настройках базы" из пункта меню "Файл".