...просто игнорировать эти операции при составлении отчетов? Простите, но мне это категорически не нравится. "Тут играем, тут не играем, тут рыбу заворачивали". Вот как раз игнорирование операций, это и есть искажение отчетов.
 
Да, операции никуда не денутся. У них будет очищено поле "Статья" потому что, по естественным причинам, невозможно знать, что должно стоять в этом поле. Но зато вы можете выбрать эти операции с неустановленным полем и проставить в нем нужно значение. То, которое вас устроит с точки зрения вашего учета. И все, проблема исчерпана.
 
К слову сказать, как часто вы удаляете счета?