Вообще-то есть похожие моменты, когда выйти/войти в программу исправляет ситуацию. См. http://www.dervish.ru/bugs-item.204/#1332187310. Может, и Ваш случай где-то рядом. У меня тоже 232 сборка. И на ней счета в указанном в ссылке случае отображаются наоборот вплоть до перезагрузки программы. При этом сумма операции имеет знак, противоположный правильному. А тут уже и до неверного остатка недалеко. Впрочем, влияет это на пересчёт остатков или нет - знает только разработчик.
 
Попробуйте ещё раз скачать и переустановить 232 сборку. Там было два варианта - один красивый, с мастером установки, второй - просто exe-файл. Я себе брала только exe-шник.
Потом попробуйте поймать ошибочную ситуацию, точно определив последовательность всех предшествующих ей действий. Например:
- первая введённая операция после запуска программы уже даёт ошибку, или нет. Если нет, то какие операции до нёё показали правильный остаток и чем "неправильная" операция отличается от них;
- каковы в этот момент настройки программы;
- какие кнопки/клавиши нажимались до этого, в какой последовательности, каким образом открывались/закрывались окна и т.п.
Кстати, а Вы по сумме не определили, какие операции программа как будто временно не учитывает? Если определите, то стоит внимательнее взглянуть на эти операции и постараться понять, как они взаимосвязаны с "ошибочной" операцией.
 
А потом отправляйте информацию об ошибке в Доработки.