"По-правильному", (каждый) кредит - это счёт, а не статья.
 
При получении кредита вы (создаёте новый кредитный счёт и) переводите с этого счёта деньги себе (остаток на счету "Кредит 1" становится отрицательным).
При погашении кредита вы создаёте операции перевода в обратную сторону ("Наличные" => "Кредит 1"), тем самым приближая остаток на кредитном счету к 0.
При этом даже никакой статьи указывать здесь не нужно - из счёта-получателя и так видно, что это погашение кредита.
 
Когда остаток на кредитном счету станет нулевым - кредит выплачен, и счёт можно закрыть (контекстное меню или Ctrl+B)
(а в настройках программы есть даже галочка, чтобы такие закрытые счета не показывались)