...не смогу угодить абсолютно всем, поэтому считаю очень важным предусмотреть возможности для обработки данных в сторонних программах, в том же Excel-е.
 

Оно конечно делается не вручную, но хотелось бы минимум лишних движений.

 
Вы данные экспортируете в экселевском формате или импортируете в эксель тот xml, который можно получить из AbilityCash? Можете описать, как именно вы автоматизировали этот процесс?
 

Пожелание для экспорта.
Предусмотреть помимо полного пути вложенности какого-то элемента классификатора выгружать в отдельные ячейки каждый элемент пути.

 
Да, это можно сделать, вот только эта информация не будет использоваться во время импорта. То есть, импорт будет воспринимать только колонку с полным путем.