Вот, скажем, расходные статьи для транспорта у меня расписаны вот так:
 
+ Все статьи расхода
---+ Транспорт
------+ Автотранспорт
---------- Автомойка
---------- Автосервис (только работа мастеров)
---------- Бензин
---------- Запчасти
---------- Налоги, сборы
---------- Стоянка
---------- Страховка
---------- Штрафы ГИБДД
------+ Общественный транспорт
---------- Автобус
---------- Метро
---------- Такси
---------- Троллейбус
 
Тут, наверное, нужны пояснения:
 
1. Поездку в автосервис я провожу двумя операциями расхода. По одной списывается работа мастеров, по второй - стоимость запчастей и расходных материалов. Собственно, потому и есть разбивка "Автосервис - работа" и "Запчасти".
 
2. Налоги, сборы - тут, безусловно, проходит транспортный налог. Кроме этого, по этой статье я провожу все, что связано с использованием а/машины, но вроде как напрямую в бюджет не идет. Например, расходы, связанные с прохождением государственного технического осмотра а/машины. Или расходы для получения медицинской справки.
 
3. Если в семье более одной машины, то машина, на которую отнесен расход, определяется не в статьях, а в отдельном классификаторе. У меня для этой цели используется классификатор "Агенты". В расходах на мою машину я проставляю агентом себя, расходы на машину жены помечаются в поле Агента "жена". Соответственно, это дает возможность оценить как общие расходы на семейный автопарк, так и каждую машину в отдельности рассмотреть.
 
Ну вот как-то так, наверное. По крайней мере, эта структура расходных статей для автотранспорта у меня работает уже очень давно.