Если программа запускается из-под акаунта без администраторского доступа, а файлы баз лежат (вместе с программой) в C:\Program Files\, например, то они тоже будут доступны только для чтения (у обычных пользователей нет права записи в Program Files).
 
Кроме того, стоит проверить атрибуты доступа NTFS. Например, даже если перенести файл из My Documents в какую-то общую папку у него может остаться разрешение на доступ только для того акаунта, в чьей папке My Documents он лежал изначально.
 
В общем, Alt+Enter (Properties) > Security > Advanced - скорее всего, там можно исправить вашу проблему.