1. Вычитание в бюджетах. Сейчас программа умеет только складывать суммы бюджетных статей в папках бюджетного дерева, но этого ИМХО недостаточно. Пример: имеем классификатор "Потребители", где перечислены члены семьи, при этом часть расходов персонифицирована, а часть общая (продукты, коммуналка) и должна разноситься на всех в равных долях. Определение полных расходов по конкретному потребителю можно сделать вычитанием из общих расходов личных расходов неучитываемых в данном бюджете потребителей. Решить это можно добавлением в "Серии данных" галки "Инвертировать".
 

 
2. Иерархическая структура в отчете "Динамика оборотов". Просто продублировать дерево бюджетов. Совместно с предложением #1 это существенно расширит возможности анализа.
 

 
3. Группировка операций. Нужна программе как воздух. Говорилось об этом много, хочу добавить только, что в свойствах родительской "папки", для группы операций можно (и нужно) указывать скидку для группы (чека), которая будет пропорционально разноситься по позициям чека в формировании бюджетов и отчетов. Сейчас делить одну операцию по многим программа не умеет и ввод дисконта (или комиссии) отдельной операцией приводит к фиктивным оборотам.