Предлагаю использовать бесплатный движок типа мантиса (http://www.mantisbt.org/) на PHP для учёта багов и пожеланий пользователей программы. По-моему будет гораздо удобнее чем нынешняя древовидная структура.
Например Far Unicode использует этот движок
http://bugs.farmanager.com/my_view_page.php